柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。　　柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，...

漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（高山南 配音）和伙伴们来到东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子（天海佑希 配音）。该女子处于失忆状态，身上的手机也破损无法使用。柯南等人答应要帮她恢复记忆，当他们七嘴八舌之际，藏在暗处的黑...

位于东京的东都线地铁开通当日，一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发，导致东都线列车损毁。经过一番推理，柯南（高山みなみ 配音）等人认定这与8年前朝仓主持负责的北之泽水坝的修建有关。当年为了修建大坝，朝仓动员北之泽村的人民搬入新村，可是仍有许多人反抗到最后阶段。为了探明真相，柯南、灰原（林原めぐみ 配音）、少年侦探团以及毛利小五郎（小山力也 配音）等人开赴白雪皑皑的北之泽。在这片纯净的雪国...

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讲述灰原哀的过往。...

概要　　史东那城市到处都有因魔力而动的魔偶，在这里的两位伯爵海建与葛拉尼欧正在争夺城镇的主导权。於是两人达成协议要以魔偶对决来决定一切。生在魔偶工匠家族的不幸少女莱雅，因家中父兄两人的不合而伤透脑筋。其父兄两人也莫名地卷入这场城主之争，并且竟然做出莉娜和娜卡的魔偶！究竟史东那城市真正的未来与和平是否真的会到来呢？...

概要　　莉娜和娜卡从坏人手中得到一张票，便前往了温泉迷们的朝圣地「米布洛斯岛」。想说应该是一趟快乐的温泉之旅，没想到在这小岛等待她们的，却是一群无恶不作的坏人集团。为了能让胸部更雄伟……不，说错了，是为了恢复城镇的和平，莉娜展开穿越时空的过去旅程。面对巨大的魔族！爆裂华丽的龙破斩！开始改写这史上最大之决战历史！　　本作虽然是原创故事，不过身为系列作的第一部，而且又是以小说版「特别篇」的步调制作而成...

概要　　只要是有美味佳肴的地方，就一定会出现一位自称美少女天才魔导士的莉娜，和一位自称是其保护者的高里。一如往常地来到以盛产章鱼闻名的海边城市，想说只需帮忙捕鱼便可免费享用章鱼美食；却因莉娜太过於热衷捕鱼，造成不只鱼群所在处，甚至连船只都遭受破坏，最後能享受到章鱼美食的只有高里……。不过这却是整个恐怖事件的起源！一食用章鱼的人就会得到所谓「只会说章鱼话」的怪病，因而高里也被传染了。但是事件演变到没...

莉娜与娜卡的面前突然出现一位泪汪汪的美少女。她的名字叫莎琳娜，十天前她所居住的比亚兹村落，被一个名为塔因的秘密组织所驱使的下级恶魔占领，她是来请求她们帮忙，并且述说恶党们还胁迫村人去做一些挖掘的工作。平常要是没有酬劳，莉娜是不会接受委托的。不过她却突然想起在比亚兹村落有著＂妖精之传说＂，便接下了此次的任务。...

莉娜和娜卡正優閒自在地在可爾多倫城市內享受美食，一群龍之集團突然出現在她們的面前。率領龍之集團的美少女瑪蕾妮和可爾多倫的士兵們展開對決，莉娜她們就這麼不知所以然地被捲入這場騷動。不過，龍之軍團卻在莉娜要施展攻擊魔法時全數逃之夭夭。卡伯特城的領主卡伯特召見她，並述說事件的起因。因為看到莉娜的身手如此厲害，便拜託她幫忙，只要將其愛女瑪蕾妮帶回，就付賞金200枚金幣。但其實這一次騷動的原因是他的女兒要求...