小智（松本梨香 配音）一行人在海上遇见了危险的风暴，流落到了橘子群岛中的亚西亚岛上，这里即将举行热闹的大型庆典，而小智在意外之中遇见了庆典的圣女弗卢拉（平松晶子 配音）。弗卢拉选中了小智作为庆典的“指挥者”，他的任务是前往三圣岛，找到隐藏在岛上的玻璃球。只有集齐三颗玻璃球，才能够正式开启庆典。　　就这样，小智和伙伴们踏上了寻找玻璃球的旅途，哪知道不仅遇到了前来捣乱的火箭队，还遭到了闪电鸟的袭击...

　　「ガースー黒光り諜報局」（ガースーくろびかりちょうほうきょく）、通称GIA（Gaasuukurobikari Intelligence Agency）として、茨城県久慈郡大子町[3]にある、東京理科大学大子研修センター（旧茨城県立大子第二高等学校跡地）でロケが行われた。...

　　「私立くちびる西高校」として、栃木県那須塩原市（旧：塩原町）にある、旧塩原町立上塩原小学校[1]でロケが行われた。校名に「くちびる」を冠しているのは、浜田を讃える校名でもある。...

　　「しゃくれ警察署（-けいさつしょ）」として、静岡県御殿場市にあった富士フェニックス短期大学[1]でロケが行われた（画面に富士急行のバスが映っていた）。　　交通機動隊の訓練所は、静岡県御殿場市小山町にある「ミニボートピア富士おやま」（2015年3月24日開業）の建立前の敷地が使用された。...

　　「ガースー附属黒光り記念病院（ガースーふぞくくろびかりきねんびょういん）」として山梨県北杜市内にある日本航空学園北杜キャンパスでロケが行われた。　　「ガースー附属黒光り記念病院・女子寮」文化創造館北稜館　　本作から「絶対に笑ってはいけない科学博士24時」まで、舞台となる施設名には「ガースー黒光り」の文字が必ず入る。...